Los primeros habitantes de lo que es hoy Capilla del Monte, fueron los Comechingones, que habitaron todo el oeste cordobés. Cabe señalar también que presencia de los Sanavirones, aborígenes del noroeste de lo que hoy es la provincia de Córdoba y parte de sudeste de Santiago del Estero. De hecho, la denominación Comechingón es una voz Sanavirona utilizada para designar a quienes habitaban en las cuevas y aleros que las formaciones rocosas les brindaron como abrigos naturales. Otra característica habitacional de los antiguos pobladores de lo que hoy es Córdoba, fueron las viviendas semisubterraneas, denominadas como "casa pozo", de las que hay escasas constataciones arqueológicas. Las crónicas de la época de la conquista describen a nuestros aborígenes como numerosas etnias con las siguientes particularidades en sus rasgos físicos: hombres altos, morenos y barbudos.
En el periodo arcaico fueron cazadores recolectores y, sobre el limite del encuentro con la conquista practicaron la agricultura incipiente y la domesticación de animales y plantas. La alfarería hallada en los sitios arqueológicos es mayoritariamente rústica y utilitaria. Una característica identificatoria de su cultura material es la punta de flecha lanceolada, en forma de hoja de laurel, que marca el horizonte ayampitin que se extendía desde Córdoba (La Falda, Pampa de Olan) hasta el noroeste de América del Sur; con una antigüedad estimada en 6000 A.C.

De la diversidad lingüística de los dialectos, agrupados en dos lenguas principales, Henia y Camiare, quedan pocos vocablos que no hayan sufrido la influencia del Quichua, en su avance de norte a sur, acompañando el paso de los encomenderos y conquistadores españoles. Sobre lo dicho cabe señalar un párrafo textual de Pbro. Pablo Cabrera "...Los aborígenes que intervienen en ellas (*) hablaban para la fecha idioma Cuzco..." Ya en 1594 Alonso Barzana decía: "Son tantas las lenguas habladas en Córdoba, que cada media lengua se tropieza otra diferente". (En Gimenez de la espada: relac. Geo. De indias. Tomo II, Ap.3)

(*) se refiere a querellas con actuación judicial Arch. De Trib., Córdoba, Escrib. 1era. Leg. 72,exp. 2,año 1639

Lucia González Jaimes, y su marido venden las tierras al Cap. Crístobal Fúnes el 2 de agosto de 1618. Éste las trueca por otras a Miguel González Jaimes, su tío, el 24 de octubre de 1620. Miguel González entregó las tierras como parte de la dote, a su hija, María Jaimes, con motivo de su casamiento con el Cap. Gerónimo de Quevedo. El 13 De abril de 1638, la propiedad es vendida a Manuela Rivera.

Sucesivas heredades y ventas nos acercan a la fecha en que el Cap. Antonio Ceballos compro el predio que tiene una extensión de cuarto de legua al norte y otra al sur, por una legua al naciente y otra al poniente. Es éste el momento en que por primera vez se implanta en el mismo, la Estancia que el Cap. Antonio Ceballos pone bajo la advocación de San Antonio. Construyendo su casa compuesta de sala y dos aposentos y otros cuartos para sus hijos y agregados, un molino y la bodega. El principal cultivo de la estancia lo constituían mil seiscientas cuarenta cepas de vid; Además de la siembra de trigo, había algunas plantaciones de frutales como manzanas, peras, higueras y membrillos. Se criaban vacas, bueyes, caballos, yeguas y mulas. Todo lo dicho se desprende del inventario efectuado después de la muerte del Cap. Antonio Ceballos, en 1719, en su estancia de San Antonio. Ese suceso anticipa nuevas ventas entre las que se destaca la perteneciente al 6 de setiembre de 1824, fecha en que es comprada por Dn. Pastor Montoya. Sus descendientes venden parte de la estancia al Dr. Adolfo Doerning, a fines del siglo XIX, y en ese momento se unifican las tierras con una mensura judicial (1885 mensura de Vilches).

El Dr. Adolfo Doering, un sabio alemán llegado al país por invitación del entonces presidente Sarmiento, fue quien hizo trazar definitivamente la planta urbana de la localidad, propagando el centro hasta la actual diag. Buenos Aires para hacerlo coincidir con la estación de ferrocarril. A tal efecto contrató los servicios profesionales de dos ingenieros suizos. Por esa época también se creo una comisión vecinal que dio las bases del primer municipio. El Dr. Doering fue presidente de la comisión directiva de la Academia Nacional de Ciencias - Córdoba - Argentina en 1918 y en esos años albergo en su residencia particular a científicos tales como los Dres. Rimann, Frenguelli, Herreo Ducloux, con quien realizo importantes relevamientos geológicos y orográficos de la región.

Además, Capilla del Monte fue pionera en el Valle de Punilla en cuanto a la planificación de sus servicios públicos, como el agua corriente, desagues cloacales y pluviales, trazado de calles, usina eléctrica, correo, escuelas y sala de primeros auxilios, entre otras obras vanguardistas de la zona, para ese momento.
La capilla primogénita que dio nombre de la localidad, fue construida a mediados del siglo XVII. Demolidos sus muros de adobes, a principios del siglo X, se levantó la actual en el mismo predio. El Pbro. Pablo Cabrera la nombra como la capilla de San Antonio del Monte y sobre este tema escribió lo que sigue: "... Y acá, un episodio, mejor dicho, una tradición relacionada con la única de las instituciones de piedra que han desfilado recién a nuestros ojos. Un día, hace ya bastante tiempo, suscitóse entre los miembros de dicho vecindario la duda sobre cual de los Antonios, si el de Padua o el de Abad, era el patrono titular de auténtico de su capilla. No teniendo aquellos ninguna de las pruebas del caso, - documentos o testimonios, - y sin esperanzas, por otra parte de adquirirlas, - resolvieron unánimemente, - era su reunión una especie de Cabildo abierto, - colocar en un recinto de su casa de oración la efigie de cada uno de los Antonios, - hoy sustituidas por nuevas, - los dos vetustos lienzos dedicados respectivamente a entrambos héroes." (Pbro. Pablo Cabrera - Punilla - desde el dique al Uritorco - noticias histórico - etnográficas sobre la región. Córdoba ( Rep. Argentina) -1931).